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澳門協和醫院首階段營運提供健康管理、專科門診服務及醫學美容，其後逐步啟動放射治療等綜合腫瘤服務及內外科住院服務等 。
北京協和醫院澳門醫學中心/澳門醫院籌備辦公室主任李偉成向傳媒介紹，醫院設自動化系統傳送樣本到實驗室。
除提供醫療衛生服務外，澳門協和醫院亦作醫學教育及醫學研究 。此外，還將設立國際醫療中心、設立腫瘤治療中心、醫學美容中心、傳統醫學中心、健康管理中心等專科。
社會文化司司長歐陽瑜接受傳媒訪問時表示，現時本澳專科初診平均輪候時間已縮短至3.6周，而澳門協和醫院最初建設的目的便是解決以往求診輪候時間長，以及治療疑難雜症需送外就醫的困難。
綜合醫院1樓大堂
李偉成早前接受由澳門特區政府新聞局出版的《澳門雜誌》訪問時表示，協和醫院以服務澳門居民為先，提供的服務盡量不與仁伯爵綜合醫院及鏡湖醫院重疊，更不會與私營醫療機構搶佔市場，並引入更多日間醫院的概念。
他指：「病人不需要長時間留宿醫院，白天過來醫院做治療，晚上可以選擇回家，或者回到酒店休息，後期的康復治療及調理更可以轉介到其他醫療機構進行。」
澳門協和醫院毗鄰澳門路氹連貫公路，總建築面積約43萬平方米，是澳門最大的醫療建築群，項目規模是衛生局轄下所有設施總面積的兩倍，包括澳門醫院、中央化驗大樓、輔助設施大樓、綜合服務行政大樓、員工宿舍大樓等主體建築。
醫院首階段設800張病床，數目與仁伯爵綜合醫院相若。第二階段會設康復醫院病床300張床。而原設於科大醫院的山頂醫院急診站將遷到澳門協和醫院 。
